天庭中有个刁蛮泼辣的小魔女神农女，一直狂恋着吴夲，见到玉帝要缉捕吴夲，她急忙赶赴人间，希望在李天王抓到吴夲之前，先找到他，带他回天庭自首，减轻罪责！

　　吴夲并不知道他私到人间已经在天庭掀起了一场滔天风波，他见到的是满目疮夷，遍地哀鸿，瘟疫肆虐。

　　吴夲心急如焚，可是人神殊途，神仙没有办法直接打救众生，治疗疾病，还须借助凡人手，吴夲找到了闽南最大的医坊，把对付瘟疫的秘方传授给医坊坊主史威，史威是闽南最负盛名的大夫，他的医坊总是挤满了求医的人，如果有了保生大帝的秘方，医坊就可以救活无数病人，然而秘方交出甚久，瘟疫依然蔓延不止，保生大帝的秘方不灵了！

　　保生大帝诧异之余，化成凡人，来到医坊明察暗访，这才发现史威得到秘方之后，并未用来救治百姓，反而用高价卖给有钱人，着实发了一笔瘟疫财。

　　此时神农女追到吴夲，并且告诉他：并不是人间缺少医药，缺少高明的医术，而是人心不古，医道不存，医德败坏，她劝吴夲速速返回天庭，以免遭到玉帝惩罚。

　　吴夲顾不得这些，瘟疫一天天蔓延，千村薜苈，万户萧疏，身为保生大帝，他岂能置身事外？

　　神农女说人性本恶，凡人不值得救，吴夲说人性本善，他要寻找一个最诚实最善良的年轻人，将他培养成一代名医，战胜瘟疫，拯救苍生！