深夜，本该无人的郊外却传来阵阵用锄头挖土的声音，仔细看去，一名身形略显肥胖的男子正在用力挖土，而男子旁边正放着一名男子的尸体！

　　清晨，一辆本该进站的209公交车却突然驶向人群，难以控制，就在车子快要撞向人群时，幸好刹住了车。周围的人们见状连忙用力打开车门，准备营救乘客，却发现车内乘客包括司机已经口吐白沫身亡。

　　一名男子匆匆走进一幢写字楼，按下电梯，来到自己的办公间，原来这名男子叫查理。查理在办公桌前坐下，电脑上显示收到一封新邮件，点开一看上面写着：我知道你做了什么。查理回复了邮件：你是谁。对方回答：目击者！对方继续发来邮件要求查理帮其办事，查理拒绝了。此时，查理手边新到的包裹里传来一阵手机铃声，查理找到手机并接起。对方传来一个男人的声音，对方用查理的女儿乔琳威胁查理帮助他去一个地方拿走一台笔记本电脑。

　　同时，特别行为分析组的五名组员和新加入的成员塔拉博士正在前往洛杉矶的飞机上分析着案件，警方已经确认全部受害者死于沙林毒气，组员们认为这很可能是邪教组织恐怖分子报复政府的“杰作”。小组成员来到案发现场，警员们找到了一个自制的使毒气延时释放的装置，由此可以推论凶手谋划这次案件很久，戴夫认为这并不是团伙作案而且沙林毒气也很有可能是自制的，因此他们将目标锁定在了化学家，并找到一名嫌疑人——约翰·盖特曼。同时，警方通过翻查案发现场的监控认为查理曾出现在现场并且行为诡异！

　　夜晚，查理将车停在停车站，步行来到一座房子前，他悄悄走进屋内，拿起桌上的笔记本转身就走，却发现一个人正躲在帘子后面，他扒开帘子一看，竟是一名陌生男子的尸体！一个小时后，警方接到报警来到这所房子，发现死者正是约翰·盖特曼！通过翻看停车站的监控，组员发现查理曾经出现在这里。

　　第二天清晨，查理又接到了神秘男子的来电，要求查理取一个包裹。同时，小组成员召开了案件的新闻发布会和完成了凶手的部分特写。戴夫和摩根来到查理的公司，通过询问查理的妻子，警员们得到了想要的讯息猜想出查理杀死了西奥，并通过调查西奥牵扯出西奥的哥哥米切尔。查理来到制定地点取到包裹，打开一开，里面竟是一个防毒面具和一套防化服。正在这时，神秘男子又打来电话，查理与其激烈争吵，神秘人又用乔琳威胁查理，正在这时，查理发现旁边驶过的黑车轿车里的一个身影很像乔琳，他连忙开车追了上去。

　　警方通过调查发现了西奥和米切尔与一个邪教组织的关系，并进一步得出结论：米切尔与西奥关系破裂并目击到查理查理杀死西奥并找查理充当替罪羊。正在这时，查理开车想要冲进联邦公安局，警员们打开查理的轿车后备箱，发现了一大堆毒气泄漏装置，警员们明白了这是米切尔的阴谋。小组成员们通过监控追踪到了米切尔的位置，正前往抓捕。而此时的米切尔正在对面的天台上等着惬意的观看他制造出的混乱，突然身后多了一把枪，米切尔不得不投降。一切都归于平静，但是查理因为故意杀人而不得不受到法律的惩罚。在回程的飞机上，非凡博士和塔拉博士正在愉快的交谈，不时传来一阵欢声笑语···