半夜，一名书生在郊外看到了一颗千年古树变成了妖怪杀人，他吓得屁滚尿流地跑回了长安城。书生一直居住在凡舍，他回到凡舍后就一会嚷嚷着藤妖杀人。顾客们都被书生说的话吓住了，这时候进来了一名道士。道士看了书生一眼就说书生被藤妖附体了，他把凡舍里的客人都赶了出去。四娘让小二们去拦住客人们收钱，可无奈客人们跑得太快，小二们没有收到钱。四娘气得就要去找道士理论，可道士却对着书生做起了法术。

过了几日，古树附近发现了几具尸体。破案小分队前往古树附近查案，他们将古树拦了起来。谭双叶发现尸体们都是死了一天以上，这时，紫苏认出了其中一个死者是官员宇文晖。回到凡舍以后，萨摩多罗把在古树看到的事情告诉了四娘，他还和四娘一起在凡舍门口演起了藤妖杀人的故事。果然，藤妖杀人的故事吸引了很多百姓前来观看。书生突然从凡舍里跑了出来，他大声告诉众人有藤妖。书生朝着萨摩多罗跑了过去，幸亏四娘打晕了书生才让他没有撞到萨摩多罗。

谭双叶为死者们验尸之后发现他们都是被一种藤草绞死的，而宇文晖的体内还有一块令牌。破案小分队决定从宇文晖的线索查起，因为宇文晖是前朝宇文家族的人。

紫苏和黄三炮一起去了宇文府里调查，宇文夫人认出了紫苏手上的令牌就是她相公余文晖的。根据宇文夫人提供的线索，他们找到了宇文晖常去的燕子楼查案。

另一边，大理寺的官差们在古树旁边抓到了想要来作法的道士，这个道士正是那天在凡舍里为书生驱妖的道士。萨摩多罗认出了道士不是中原人，他觉得道士和他一样是伽蓝人。为了查案，萨摩多罗故意化装后进入了大牢，他被关到了书生和道士的旁边。不料当晚，大牢里突然失火，书生死在了牢里。李郅和紫苏来到了大牢里，他们发现萨摩多罗的神情似乎有些不对。萨摩多罗问李郅，那个死去的书生是不是中毒而死。李郅查看了书生的尸体，他说书生确实是中毒而死。萨摩多罗怀疑书生是被道士所杀，而道士和伽蓝的除妖师是一伙人。

四娘听说了萨摩多罗在大牢里发生的事，她担心萨摩多罗会被击倒。四娘去了牢里见萨摩多罗，她让萨摩多罗不要胡思乱想。萨摩多罗被狱卒诬陷为杀害书生的凶手，幸好李郅出面帮萨摩多罗作证。就在李郅和萨摩多罗回到凡舍后，他们却听说四娘去了古树。破案小分队急忙跑去了古树，他们找到了在古树下的四娘。四娘告诉他们，紫苏不见了。

破案小分队在树林旁找到了紫苏留下来的珍珠，顺着珍珠他们找到了河边。河边有一艘大船，他们上船后用宇文晖和书生的玉牌将船门打开了。这时候，一个男人用刀挟持着紫苏出现了。原来这个男人竟然是前隋朝的杨家人，他是为了得到杨家的宝藏才杀死这些人的。杨家的人把破案小分队关在了船里，可他却被突然出现的黑伽罗杀死了。众人因为担心紫苏的情况就没有再追上去，他们想办法从船上逃了出去。

晚上，四娘和萨摩多罗因为白天发生的事而难过。四娘想起了失踪的儿子，而萨摩多罗想起了被灭的伽蓝国。